1．離子遷移技術的原理是采用電離源將中性分子電離成離子，再在電場作用下漂移，不同的離子的遷移率不同，從而將其鑒別出來。熒光淬滅技術的探測是用專門設計的熒光材料對爆炸物的熒光淬滅/增強來達到的。所以從原理上來看，離子遷移技術是通用性技術，可以測任適于電離的物質，而熒光技術是專對爆炸物開發的，因此熒光技術比離子遷移技術有更好的選擇性，誤報率較低。

離子遷移技術中，被檢測的樣品蒸汽或微粒氣化后需經過一層半滲透膜濾除其中的煙霧、水份等雜質，然后進入電離區，產生離子，再進入漂移區，最后達到收集區。而熒光淬滅技術只需要被測蒸汽經過熒光涂層就可以了。從工作方式上看，離子遷移要復雜的多，進氣道在探測前還需濾網，這就造成以下缺點。

2．由于進氣道復雜，因此離子遷移機器在檢測到大劑量陽性探測物后，進氣道容易造成殘留（中毒現象），且很難清洗，清洗時間或長達數小時。而熒光淬滅技術進氣道簡單，且采用玻璃管（耗材）作為熒光載體后，進氣道直接是耗材構成，更換耗材就相當于更換了氣道，不會出現機器內部中毒現象,。

3．由于內部復雜，因此離子遷移類儀器需要較長時間穩定機器內部的狀態。因此，該類機器啟動預熱時間一般較長，在20分鐘左右。而熒光淬滅類機器只需3-5分鐘的預熱啟動時間。

4．由于需要將被測物體電離，因此離子遷移譜儀經常需內置放射物品，對環境、操作員、儀器安裝等都造成困難。而熒光淬滅技術無此困擾。

5．由于結構復雜，因此離子遷移類機器一般體積較大（半個手提箱大�。�、重量一般在5公斤左右。而熒光淬滅技術機器結構小巧，可方便掛于腰間，易于攜帶，一代產品重量0.7公斤，二代產品重量在1.2公斤。

6．同樣的，由于結構上的復雜性和濾網的存在，離子遷移儀器在沙塵大、濕度大環境惡劣的地方工作維護成本很高而熒光類儀器無此問題。